Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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