Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gbx1P82976 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx1P82976 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms