Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms