Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx1P81068 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx1P81068 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx1P81068 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx1P81068 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx1P81068 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx1P81068 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx1P81068 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx1P81068 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms