Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otx1P80205 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx1P80205 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx1P80205 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx1P80205 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx1P80205 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx1P80205 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms