Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb6P70689 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb6P70689 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms