Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sparcl1P70663 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sparcl1P70663 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sparcl1P70663 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms