Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ext2P70428 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ext2P70428 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ext2P70428 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ext2P70428 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ext2P70428 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ext2P70428 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms