Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx3P70354 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msx3P70354 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx3P70354 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msx3P70354 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms