Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprvP70289 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprvP70289 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprvP70289 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprvP70289 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprvP70289 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprvP70289 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprvP70289 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprvP70289 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprvP70289 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprvP70289 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprvP70289 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprvP70289 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprvP70289 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprvP70289 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprvP70289 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms