Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sycp3P70281 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sycp3P70281 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms