Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtgdrP70263 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgdrP70263 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtgdrP70263 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgdrP70263 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgdrP70263 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgdrP70263 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms