Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chl1P70232 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chl1P70232 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chl1P70232 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chl1P70232 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Chl1P70232 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Chl1P70232 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chl1P70232 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chl1P70232 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chl1P70232 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chl1P70232 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chl1P70232 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chl1P70232 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms