Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DccP70211 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DccP70211 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DccP70211 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DccP70211 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DccP70211 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DccP70211 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DccP70211 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DccP70211 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DccP70211 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DccP70211 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DccP70211 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DccP70211 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
DccP70211 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
DccP70211 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
DccP70211 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DccP70211 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DccP70211 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DccP70211 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DccP70211 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DccP70211 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DccP70211 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DccP70211 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DccP70211 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DccP70211 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DccP70211 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DccP70211 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DccP70211 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DccP70211 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DccP70211 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DccP70211 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DccP70211 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DccP70211 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DccP70211 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DccP70211 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DccP70211 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DccP70211 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DccP70211 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DccP70211 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DccP70211 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DccP70211 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DccP70211 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DccP70211 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DccP70211 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
DccP70211 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
DccP70211 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DccP70211 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
DccP70211 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DccP70211 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DccP70211 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DccP70211 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DccP70211 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DccP70211 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DccP70211 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DccP70211 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DccP70211 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DccP70211 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DccP70211 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DccP70211 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DccP70211 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DccP70211 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DccP70211 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DccP70211 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DccP70211 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DccP70211 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DccP70211 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DccP70211 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DccP70211 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DccP70211 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DccP70211 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DccP70211 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DccP70211 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DccP70211 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DccP70211 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DccP70211 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DccP70211 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DccP70211 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DccP70211 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DccP70211 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DccP70211 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DccP70211 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DccP70211 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DccP70211 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DccP70211 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DccP70211 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DccP70211 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DccP70211 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DccP70211 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DccP70211 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DccP70211 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DccP70211 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DccP70211 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DccP70211 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DccP70211 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DccP70211 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DccP70211 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DccP70211 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DccP70211 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DccP70211 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DccP70211 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms