Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig1P70193 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms