Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg2P63268 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg2P63268 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg2P63268 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg2P63268 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg2P63268 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg2P63268 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg2P63268 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg2P63268 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms