Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtnP63089 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtnP63089 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtnP63089 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtnP63089 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtnP63089 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtnP63089 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtnP63089 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtnP63089 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtnP63089 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtnP63089 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtnP63089 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtnP63089 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtnP63089 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtnP63089 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtnP63089 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtnP63089 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtnP63089 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtnP63089 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtnP63089 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtnP63089 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtnP63089 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtnP63089 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtnP63089 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtnP63089 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtnP63089 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtnP63089 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtnP63089 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtnP63089 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtnP63089 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtnP63089 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtnP63089 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtnP63089 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtnP63089 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtnP63089 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtnP63089 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtnP63089 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtnP63089 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtnP63089 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtnP63089 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtnP63089 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtnP63089 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtnP63089 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtnP63089 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtnP63089 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtnP63089 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtnP63089 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtnP63089 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtnP63089 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtnP63089 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtnP63089 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtnP63089 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtnP63089 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtnP63089 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtnP63089 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtnP63089 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtnP63089 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtnP63089 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtnP63089 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtnP63089 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtnP63089 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtnP63089 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtnP63089 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtnP63089 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtnP63089 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtnP63089 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtnP63089 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtnP63089 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtnP63089 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtnP63089 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtnP63089 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtnP63089 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtnP63089 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtnP63089 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtnP63089 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtnP63089 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtnP63089 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtnP63089 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtnP63089 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtnP63089 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtnP63089 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtnP63089 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtnP63089 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms