Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp2P63044 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms