Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23P62830 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms