Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhobP62746 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhobP62746 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhobP62746 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhobP62746 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhobP62746 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhobP62746 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhobP62746 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhobP62746 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhobP62746 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhobP62746 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhobP62746 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhobP62746 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhobP62746 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhobP62746 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhobP62746 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhobP62746 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhobP62746 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhobP62746 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhobP62746 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RhobP62746 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhobP62746 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhobP62746 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhobP62746 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhobP62746 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhobP62746 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhobP62746 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhobP62746 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhobP62746 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhobP62746 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhobP62746 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhobP62746 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhobP62746 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms