Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acta2P62737 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acta2P62737 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta2P62737 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta2P62737 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acta2P62737 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Acta2P62737 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta2P62737 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta2P62737 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acta2P62737 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms