Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnrpfP62307 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SnrpfP62307 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpfP62307 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpfP62307 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpfP62307 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpfP62307 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpfP62307 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms