Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps13P62301 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps13P62301 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps13P62301 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps13P62301 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps13P62301 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps13P62301 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rps13P62301 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rps13P62301 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms