Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrch1P62046 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrch1P62046 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrch1P62046 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms