Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms