Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnnP61807 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnnP61807 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnnP61807 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnnP61807 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnnP61807 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnnP61807 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnnP61807 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnnP61807 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnnP61807 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnnP61807 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnnP61807 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnnP61807 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnnP61807 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SnnP61807 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SnnP61807 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnnP61807 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnnP61807 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnnP61807 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SnnP61807 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnnP61807 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SnnP61807 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SnnP61807 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SnnP61807 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnnP61807 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnnP61807 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnnP61807 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnnP61807 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnnP61807 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnnP61807 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnnP61807 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnnP61807 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnnP61807 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnnP61807 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SnnP61807 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SnnP61807 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SnnP61807 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SnnP61807 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SnnP61807 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SnnP61807 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnnP61807 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnnP61807 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SnnP61807 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnnP61807 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnnP61807 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnnP61807 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnnP61807 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnnP61807 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnnP61807 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnnP61807 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnnP61807 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnnP61807 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnnP61807 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SnnP61807 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnnP61807 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnnP61807 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnnP61807 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnnP61807 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnnP61807 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnnP61807 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnnP61807 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnnP61807 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnnP61807 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnnP61807 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnnP61807 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnnP61807 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SnnP61807 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnnP61807 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnnP61807 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnnP61807 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnnP61807 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnnP61807 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnnP61807 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnnP61807 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnnP61807 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms