Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vbp1P61759 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms