Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms