Protein–RNA interactions for Protein: P61027

Rab10, Ras-related protein Rab-10, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab10P61027 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab10P61027 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab10P61027 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab10P61027 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab10P61027 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab10P61027 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab10P61027 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab10P61027 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab10P61027 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rab10P61027 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab10P61027 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab10P61027 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms