Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rims4P60191 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rims4P60191 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms