Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps5P59438 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps5P59438 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hps5P59438 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps5P59438 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps5P59438 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps5P59438 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hps5P59438 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps5P59438 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps5P59438 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps5P59438 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps5P59438 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms