Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp4P59240 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms