Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scarf2P59222 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf2P59222 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms