Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrnp1P59054 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrnp1P59054 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp1P59054 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp1P59054 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp1P59054 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp1P59054 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrnp1P59054 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrnp1P59054 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrnp1P59054 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrnp1P59054 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrnp1P59054 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrnp1P59054 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrnp1P59054 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Csrnp1P59054 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp1P59054 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms