Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P58686 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P58686 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P58686 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P58686 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P58686 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P58686 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P58686 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P58686 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P58686 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P58686 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P58686 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P58686 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P58686 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P58686 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P58686 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P58686 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P58686 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
P58686 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P58686 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P58686 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P58686 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P58686 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P58686 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P58686 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P58686 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P58686 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P58686 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
P58686 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P58686 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P58686 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P58686 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P58686 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P58686 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P58686 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P58686 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P58686 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P58686 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P58686 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P58686 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P58686 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P58686 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
P58686 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P58686 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P58686 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P58686 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P58686 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P58686 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
P58686 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P58686 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P58686 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P58686 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P58686 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P58686 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P58686 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P58686 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P58686 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P58686 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P58686 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P58686 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P58686 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P58686 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P58686 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P58686 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P58686 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P58686 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P58686 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P58686 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P58686 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P58686 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P58686 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P58686 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P58686 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P58686 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P58686 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P58686 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P58686 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
P58686 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P58686 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P58686 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P58686 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P58686 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P58686 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P58686 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P58686 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P58686 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P58686 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P58686 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms