Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdsp1P58466 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms