Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rce1P57791 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rce1P57791 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rce1P57791 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rce1P57791 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rce1P57791 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rce1P57791 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms