Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp25P57080 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp25P57080 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp25P57080 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp25P57080 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp25P57080 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms