Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FusP56959 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FusP56959 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FusP56959 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FusP56959 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FusP56959 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FusP56959 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FusP56959 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FusP56959 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FusP56959 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FusP56959 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FusP56959 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FusP56959 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FusP56959 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FusP56959 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FusP56959 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FusP56959 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FusP56959 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FusP56959 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FusP56959 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FusP56959 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FusP56959 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FusP56959 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FusP56959 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FusP56959 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FusP56959 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FusP56959 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FusP56959 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FusP56959 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FusP56959 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FusP56959 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FusP56959 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FusP56959 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FusP56959 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FusP56959 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FusP56959 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FusP56959 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FusP56959 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FusP56959 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FusP56959 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FusP56959 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FusP56959 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms