Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctbp2P56546 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ctbp2P56546 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms