Protein–RNA interactions for Protein: P56391

Cox6b1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6b1P56391 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6b1P56391 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox6b1P56391 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms