Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GferP56213 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GferP56213 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GferP56213 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GferP56213 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GferP56213 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GferP56213 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GferP56213 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GferP56213 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GferP56213 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GferP56213 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GferP56213 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GferP56213 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GferP56213 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GferP56213 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GferP56213 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GferP56213 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GferP56213 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GferP56213 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GferP56213 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GferP56213 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GferP56213 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GferP56213 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GferP56213 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GferP56213 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GferP56213 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GferP56213 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GferP56213 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GferP56213 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GferP56213 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GferP56213 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GferP56213 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GferP56213 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GferP56213 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GferP56213 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GferP56213 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GferP56213 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GferP56213 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GferP56213 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GferP56213 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms