Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NcanP55066 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NcanP55066 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NcanP55066 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NcanP55066 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NcanP55066 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcanP55066 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcanP55066 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcanP55066 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcanP55066 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcanP55066 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcanP55066 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcanP55066 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcanP55066 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcanP55066 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NcanP55066 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcanP55066 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcanP55066 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcanP55066 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcanP55066 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NcanP55066 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NcanP55066 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NcanP55066 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NcanP55066 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NcanP55066 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NcanP55066 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NcanP55066 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NcanP55066 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NcanP55066 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NcanP55066 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NcanP55066 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NcanP55066 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NcanP55066 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NcanP55066 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NcanP55066 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NcanP55066 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NcanP55066 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NcanP55066 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NcanP55066 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NcanP55066 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NcanP55066 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NcanP55066 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NcanP55066 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NcanP55066 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NcanP55066 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NcanP55066 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NcanP55066 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NcanP55066 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NcanP55066 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NcanP55066 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NcanP55066 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NcanP55066 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcanP55066 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcanP55066 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcanP55066 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcanP55066 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcanP55066 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcanP55066 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcanP55066 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcanP55066 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcanP55066 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcanP55066 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcanP55066 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NcanP55066 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NcanP55066 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NcanP55066 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NcanP55066 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NcanP55066 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NcanP55066 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NcanP55066 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NcanP55066 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NcanP55066 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NcanP55066 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NcanP55066 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NcanP55066 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NcanP55066 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NcanP55066 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NcanP55066 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NcanP55066 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NcanP55066 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NcanP55066 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NcanP55066 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NcanP55066 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NcanP55066 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NcanP55066 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NcanP55066 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NcanP55066 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NcanP55066 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NcanP55066 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NcanP55066 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NcanP55066 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NcanP55066 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NcanP55066 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NcanP55066 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NcanP55066 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NcanP55066 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NcanP55066 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NcanP55066 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NcanP55066 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcanP55066 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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