Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GemP55041 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GemP55041 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GemP55041 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GemP55041 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GemP55041 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GemP55041 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GemP55041 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GemP55041 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GemP55041 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GemP55041 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GemP55041 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GemP55041 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GemP55041 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GemP55041 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GemP55041 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GemP55041 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GemP55041 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GemP55041 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GemP55041 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GemP55041 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GemP55041 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GemP55041 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GemP55041 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GemP55041 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GemP55041 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GemP55041 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GemP55041 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GemP55041 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GemP55041 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GemP55041 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GemP55041 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GemP55041 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GemP55041 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GemP55041 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GemP55041 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GemP55041 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GemP55041 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GemP55041 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GemP55041 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GemP55041 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GemP55041 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GemP55041 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GemP55041 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GemP55041 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GemP55041 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GemP55041 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GemP55041 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GemP55041 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GemP55041 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GemP55041 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GemP55041 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GemP55041 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GemP55041 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GemP55041 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GemP55041 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GemP55041 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GemP55041 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GemP55041 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GemP55041 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GemP55041 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GemP55041 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GemP55041 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GemP55041 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GemP55041 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GemP55041 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GemP55041 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GemP55041 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GemP55041 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GemP55041 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GemP55041 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GemP55041 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GemP55041 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GemP55041 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GemP55041 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GemP55041 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GemP55041 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GemP55041 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GemP55041 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GemP55041 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GemP55041 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GemP55041 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GemP55041 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GemP55041 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GemP55041 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GemP55041 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GemP55041 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms