Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc12a1P55014 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc12a1P55014 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc12a1P55014 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms