Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms