Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cacnb3P54285 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms