Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolgP54099 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PolgP54099 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PolgP54099 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PolgP54099 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolgP54099 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolgP54099 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolgP54099 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolgP54099 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolgP54099 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolgP54099 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolgP54099 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolgP54099 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolgP54099 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolgP54099 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolgP54099 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolgP54099 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PolgP54099 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolgP54099 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolgP54099 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolgP54099 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PolgP54099 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolgP54099 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolgP54099 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolgP54099 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolgP54099 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolgP54099 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolgP54099 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolgP54099 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolgP54099 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolgP54099 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolgP54099 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolgP54099 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolgP54099 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolgP54099 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolgP54099 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolgP54099 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolgP54099 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolgP54099 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolgP54099 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolgP54099 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolgP54099 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolgP54099 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolgP54099 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolgP54099 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolgP54099 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolgP54099 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolgP54099 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PolgP54099 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PolgP54099 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolgP54099 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolgP54099 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolgP54099 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolgP54099 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolgP54099 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PolgP54099 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolgP54099 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolgP54099 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolgP54099 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolgP54099 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolgP54099 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PolgP54099 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PolgP54099 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PolgP54099 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PolgP54099 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PolgP54099 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PolgP54099 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PolgP54099 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolgP54099 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolgP54099 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolgP54099 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolgP54099 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolgP54099 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms