Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ClgnP52194 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ClgnP52194 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ClgnP52194 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ClgnP52194 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ClgnP52194 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ClgnP52194 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClgnP52194 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClgnP52194 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClgnP52194 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ClgnP52194 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ClgnP52194 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms