Protein–RNA interactions for Protein: P51954

Nek1, Serine/threonine-protein kinase Nek1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek1P51954 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek1P51954 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek1P51954 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek1P51954 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek1P51954 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek1P51954 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nek1P51954 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek1P51954 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek1P51954 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek1P51954 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek1P51954 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms